当然有啦。不过先说哦，题目说是拼音方案，言下之意说应该是转写方案，故以《通字方案》为代表的所有非时音方案要排除掉；还要区别声调，那么以《拉丁化新文字》一系不标声调的方案也不在此列。想了下，方案不多，印象中除国罗外主要有如下两个：

1923年周辨明方案（周辨明一式）：
周辨明于1923年发表《中华国语音声字制 (Cuqhua Kuoyy Insheqzïh Cïh) 》，由厦门大学语言科学系出版。详细介绍了此方案的拼写规则。周辨明本人是著名语言学家，又是拉丁化的大拿，且和赵元任有交情匪浅。这个方案虽然发表时间比国语罗马字的正式发布稍早，但其实和赵元任与国罗脱不了关系，周辨明在该书序言就提到：

……这个制度（指拉丁化）的要领是赵元任先生主张的。他在美国哈佛大学教美国人中国话，曾经实验过他的拟案（指国语罗马字草稿），并已有很满意的成绩。他把他的拟案的要旨寄给我看，我看了就起手修改一番。新近我的朋友林玉堂（林语堂）先生从德国回来，我们俩又共同修改一番。后来我又自己斟酌改订一过，我们这个音声字制就是这样产生出来的。……

该方案的设计思路明显能看出继承自赵先生《国语罗马字的研究》，但其在拼法上自有特点。字母选用上，周辨明要凸显声母送气和不送气的特征，预留 b, d, g 来拼写浊音，不用来拼写官话不送气声母，这和国罗很不同。声调规则上，不像国罗多靠韵母异拼来区分声调，周辨明一式同时使用声母异拼和韵母异拼来区别四声。简要来说，声母变化来区分平声的阴阳，韵母异拼区分上声与去声，用附加撇号以标识入声。这样拼式的变化有更多的腾挪空间，使得规则简明易学、整齐划一，不若国罗那样规则繁复。缺点就是拼式有时颇为怪异。

简要规则：

例子：

----Fenge shiann----

周辨明的方案是拼写官话的。拼写粤音的，也有一套异拼辨调方案。

1947年Barnett–Chao 方案（粤语罗马字）

看名称就知道是赵元任的手笔啦，初在1947年的教科书 Cantonese Primer 中使用，该书由 Harvard University Press 出版。后来 Kenneth Barnett 略作修订。思路和国语罗马字类似，但粤语声调比国语复杂，因此标调规则繁复倍之。该方案使用两套声母，表示高低（阴阳）两调，用四种韵母变化，来表示四声，但另用两个符号来指示变音。
具体拼法维基百科里有了，就不再赘述：
https://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%B2%A4%E8%AF%AD%E7%BD%97%E9%A9%AC%E5%AD%97
从维基里贴个例子好了，感受一下：

Ngox yao iatkoh bhangyao kiwdzow Dhaam Patdheng. Nhi°-way* sinshaang tzoy cong'ih koag shutwah, shoxyix yandey kiw ghoe dzow Laushengkei°, yaw kiw ghoe dzow Pohiam°-dhoai. Ghoe yehmaanx-xaak° fann-jeuk-cox dzaw faat xoaixao-moq. Ciudhautzoo iat seag-cox yaw dzihkee iatkohyan* xaeshuh koag shutwah. Xee shan yixhaw kinn-cox yan, kamx dzaw kaq mushae koag lha°.
我有一個朋友叫做談不停。呢位先生最鍾意講說話，所以人地叫佢做留聲機，又叫佢做播音台。佢夜晚黑瞓着咗就發開口夢。朝頭早一醒咗又自己一個人喺處講說話。起身以後見咗人，咁就更唔使講啦。

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总体来说，异拼标调的思路始于赵元任，之后种种的类似方案，几乎都和赵元任有关联，可谓赵氏的趣味所在，也是在汉语拉丁化浪潮中赵元任一派的显著特色。但是这种明显学院派的设计，实在是于教学颇为不利。过度注重拼法拼法的优美精巧，录入便利，却很难使人快速掌握，学习时间和难度大增。对于普通人来说，无论作为注音工具还是文字，都不是便利选择。